Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ambra1A2AH22 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ambra1A2AH22 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms