Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frmpd4A2AFR3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frmpd4A2AFR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms