Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930447F04RikA2AFR2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930447F04RikA2AFR2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930447F04RikA2AFR2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms