Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C87977A2A958 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C87977A2A958 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms