Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms