Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb4A2A863 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Itgb4A2A863 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb4A2A863 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms