Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4bA2A432 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul4bA2A432 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul4bA2A432 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms