Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc173A0JLY1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc173A0JLY1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc173A0JLY1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms