Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv13-2A0A140T8N6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv13-2A0A140T8N6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv13-2A0A140T8N6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv13-2A0A140T8N6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv13-2A0A140T8N6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv13-2A0A140T8N6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv13-2A0A140T8N6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv13-2A0A140T8N6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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