Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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