Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms