Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms