Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms