Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms