Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U6N9 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U6N9 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U6N9 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U6N9 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U6N9 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Q3U6N9 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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