Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
H3f3aP84244 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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