Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbdsP70122 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbdsP70122 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms