Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 4931431B13Rik-202ENSMUST00000205646 473 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms