Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp4P35123 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms