Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fv4P11370 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms