Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm28436-201ENSMUST00000186307 698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms