Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb1P09055 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb1P09055 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms