Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms