Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm11279-201ENSMUST00000121524 1256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sprr1a-201ENSMUST00000054599 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm24556-201ENSMUST00000104547 130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Olfr122-201ENSMUST00000119082 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Hmox2-203ENSMUST00000120232 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm13450-201ENSMUST00000121107 167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm43290-201ENSMUST00000200359 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tollip-203ENSMUST00000130439 1892 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Csl-201ENSMUST00000056085 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Eif5a-204ENSMUST00000108607 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm17868-201ENSMUST00000192761 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ctsw-201ENSMUST00000025844 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tex43-201ENSMUST00000035640 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms