Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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