Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms