Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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