Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otud1Q9CUB6 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otud1Q9CUB6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otud1Q9CUB6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otud1Q9CUB6 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otud1Q9CUB6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otud1Q9CUB6 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otud1Q9CUB6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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