Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms