Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20907-201ENSMUST00000185201 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20919-201ENSMUST00000185282 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21785-201ENSMUST00000185440 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21808-201ENSMUST00000185495 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20898-201ENSMUST00000185598 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20800-201ENSMUST00000185634 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20902-201ENSMUST00000185643 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21268-201ENSMUST00000185646 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21257-201ENSMUST00000185655 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21733-201ENSMUST00000185670 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms