Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms