Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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ChfrQ810L3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ChfrQ810L3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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