Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms