Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skap2Q3UND0 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms