Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms