Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 9530056K15Rik-201ENSMUST00000061947 2315 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TrioQ0KL02 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm34727-201ENSMUST00000195175 529 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 AC154548.2-201ENSMUST00000224621 469 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm14686-201ENSMUST00000119926 343 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms