Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Siah1bQ06985 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms