Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms