Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin2bQ01097 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms