Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbdsP70122 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms