Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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