Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Il1r2-201ENSMUST00000027243 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 1810007D17Rik-201ENSMUST00000187629 742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC154729.1-201ENSMUST00000224481 1501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm24556-201ENSMUST00000104547 130 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm12250-201ENSMUST00000119467 1274 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Nectin3-205ENSMUST00000121245 953 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC140244.1-201ENSMUST00000228454 229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm15499-201ENSMUST00000141390 422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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