Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb3P09026 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms