Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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