Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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