Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 4930573I07Rik-202ENSMUST00000199120 413 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC154706.1-201ENSMUST00000225482 585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ccdc146-201ENSMUST00000030552 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pip5k1bos-201ENSMUST00000126936 684 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm36569-201ENSMUST00000195082 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm8992-201ENSMUST00000204463 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Tmem147-207ENSMUST00000209065 727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Prpf39-201ENSMUST00000120580 4069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm13864-201ENSMUST00000119745 785 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm25687-201ENSMUST00000175442 241 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gm10113-201ENSMUST00000072437 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Lgals8-206ENSMUST00000135166 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NhsB1AV60 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms