Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Spag8-201ENSMUST00000084646 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc1-203ENSMUST00000167977 4604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc1-201ENSMUST00000035800 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vamp5Q9Z2P8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms