Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ubl3Q9Z2M6 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms