Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrfQ9JM73 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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