Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk3aQ9JKX8 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms